就目前國內的情況而言，自閉癥兒童的感覺統合訓練已經取得了很大成熟性 成功性，但還是存在有一定的問題和缺陷。感覺統合訓練對自閉癥療效應科學評估，既不能夸大也不能低估。
感覺統合運動是自閉癥孩子日后所有能力發展的基礎。但從臨床觀察來看，很多自閉癥孩子在視覺、聽覺、觸覺和前庭平衡覺等方面存在不同程度的功能失調。感覺運動方面的障礙會限制自閉癥孩子從外界獲取有益的信息刺激，同時也阻礙了他們發展自身潛在的認知和社會能力。因而，感知覺運動方面的訓練一直是推動自閉癥孩子發展的重要手段之一。
訓練難以兼顧各個程度的兒童。自閉癥作為一種譜系障礙，個體差異較大，每個孤獨癥兒童都有其獨特的行為表現。有的兒童平衡能力較差，不能跨障礙設施，不敢走平衡木等，而有的兒童協調能力很好，幾乎能完成每項活動。隨著時間的推移那些協調能力好的兒童，在感統室對各項器材都能較靈活應用，因而易產生厭倦情緒，上課時間只是隨意根據個人喜好玩一種或幾種器材，感覺統合訓練對他們來說沒能起到有針對性地改善其某方面功能不足、或通過訓練延伸提高兒童的其他方面能力的實質性作用。
